Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms