Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RFXAPO00287 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms