Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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