Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
UBXN4Q92575 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms