Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC142Q17RM4 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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CCDC142Q17RM4 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC142Q17RM4 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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