Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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