Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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SIX1Q15475 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SIX1Q15475 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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