| RUNX3 | Q13761 | AC010200.2-201 | ENST00000605098 | 235 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | YPEL5P2-201 | ENST00000605553 | 359 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL365400.2-201 | ENST00000605604 | 902 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-5P-201 | ENST00000607255 | 135 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004825.2-201 | ENST00000616634 | 455 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC139769.3-201 | ENST00000618383 | 175 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC233309.1-201 | ENST00000619522 | 751 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104971.4-201 | ENST00000622763 | 249 nt | TSL 5 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015726.3-201 | ENST00000624501 | 418 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006927.4-201 | ENST00000639187 | 543 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC096656.1-201 | ENST00000623826 | 1364 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGPD1-202 | ENST00000409776 | 6692 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009313.2-201 | ENST00000417893 | 1941 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMEM71-201 | ENST00000356838 | 1993 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF682-209 | ENST00000597972 | 1538 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FKTN-201 | ENST00000223528 | 7364 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAH8-202 | ENST00000359357 | 13864 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANGPTL1-202 | ENST00000367629 | 2289 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KTN1-223 | ENST00000555573 | 1712 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RTN4-209 | ENST00000405240 | 4061 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-304P-201 | ENST00000364855 | 107 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DFNB59-201 | ENST00000375129 | 1202 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA48.2-201 | ENST00000390926 | 124 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYCP3-202 | ENST00000392924 | 845 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C8orf22-202 | ENST00000399653 | 1272 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP53-201 | ENST00000411337 | 315 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092745.2-202 | ENST00000411880 | 369 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01709-201 | ENST00000415532 | 634 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RAC1P3-201 | ENST00000416129 | 580 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4435-2HG-206 | ENST00000432818 | 572 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007179.2-204 | ENST00000444001 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IFNWP4-201 | ENST00000453148 | 294 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355314.1-201 | ENST00000453639 | 316 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356270.1-201 | ENST00000456587 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098851.1-201 | ENST00000476561 | 570 nt | TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | S100A11P1-201 | ENST00000477525 | 312 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098587.1-201 | ENST00000508241 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02353-201 | ENST00000515181 | 849 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP154-201 | ENST00000516193 | 111 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027801.4-201 | ENST00000518420 | 395 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC100782.1-201 | ENST00000520778 | 590 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01405-202 | ENST00000547607 | 674 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026888.1-201 | ENST00000553348 | 559 nt | TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF971P-201 | ENST00000562068 | 1249 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ACTR3BP1-201 | ENST00000605584 | 1247 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015813.4-201 | ENST00000610469 | 179 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLCE1-AS2-211 | ENST00000613585 | 542 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U6.48-201 | ENST00000618523 | 106 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR8057-201 | ENST00000620957 | 69 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104985.3-201 | ENST00000623479 | 597 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02246-205 | ENST00000627623 | 417 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTAR1-202 | ENST00000377200 | 9876 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POPDC3-201 | ENST00000254765 | 1345 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TLR8-202 | ENST00000311912 | 3367 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNOT6L-201 | ENST00000504123 | 8843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021086.1-201 | ENST00000499025 | 1569 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL592437.2-201 | ENST00000421655 | 2434 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLEKHG7-203 | ENST00000638590 | 3267 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABRG2-221 | ENST00000639683 | 3600 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049555.1-201 | ENST00000562834 | 1933 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133412.1-201 | ENST00000380194 | 2992 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM208A-202 | ENST00000431842 | 7119 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPINK1-201 | ENST00000296695 | 542 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR448-201 | ENST00000362131 | 111 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORD74.4-201 | ENST00000364129 | 80 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRC2-201 | ENST00000381901 | 1211 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRC2-202 | ENST00000381902 | 1221 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GUCA1C-202 | ENST00000393963 | 900 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNAJC19P6-201 | ENST00000401853 | 280 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CoTC_ribozyme.1-201 | ENST00000408104 | 192 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1303-201 | ENST00000408625 | 86 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP111-201 | ENST00000410349 | 271 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z93403.1-201 | ENST00000411879 | 895 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006007.1-201 | ENST00000422084 | 672 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00266-4P-201 | ENST00000427373 | 842 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FKBP7-205 | ENST00000434643 | 666 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DIAPH3-AS1-203 | ENST00000435636 | 467 nt | TSL 2 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00484-204 | ENST00000439438 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092170.1-201 | ENST00000440211 | 356 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELOCP10-201 | ENST00000440624 | 327 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10R1P-201 | ENST00000441524 | 1141 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P30-201 | ENST00000443431 | 335 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPTE2P6-203 | ENST00000450973 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND6P6-201 | ENST00000478031 | 263 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC069499.1-201 | ENST00000489433 | 509 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LNCSRLR-201 | ENST00000490375 | 709 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RHOBTB3-204 | ENST00000504179 | 883 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC107463.1-203 | ENST00000509713 | 284 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Y_RNA.717-201 | ENST00000517106 | 92 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC023202.1-201 | ENST00000521681 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OOSP2-203 | ENST00000532905 | 496 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC135001.1-201 | ENST00000544546 | 283 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01965-204 | ENST00000545549 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC026116.1-201 | ENST00000551729 | 474 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355102.1-201 | ENST00000555383 | 460 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012404.2-201 | ENST00000558572 | 481 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138907.2-201 | ENST00000561479 | 866 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC145350.4-201 | ENST00000562827 | 866 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC133485.5-201 | ENST00000563407 | 866 nt | TSL 3 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445435.1-201 | ENST00000604232 | 665 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |