Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
FOXO1Q12778 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms