Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRDP23468 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRDP23468 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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