Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRBP23467 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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