Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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