Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
LRRTM2O43300 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
LRRTM2O43300 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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