Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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VAMP3Q15836 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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