Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
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HERC1Q15751 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HERC1Q15751 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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