Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HMGN3Q15651 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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