Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMB3Q13751 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms