Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms