Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
CLN3Q13286 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CLN3Q13286 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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