Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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