Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SCAPQ12770 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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