Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CHRNEQ04844 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms