Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTPRBP23467 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRBP23467 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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