Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXQ1Q9C009 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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