Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC9Q96Q05 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms