Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
FXNQ16595 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
FXNQ16595 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.3 ms