Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF4Q15306 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF4Q15306 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms