Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HTR4Q13639 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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HTR4Q13639 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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HTR4Q13639 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HTR4Q13639 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HTR4Q13639 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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HTR4Q13639 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HTR4Q13639 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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