Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCIRG1Q13488 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCIRG1Q13488 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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