Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCOF1Q13428 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCOF1Q13428 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TCOF1Q13428 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
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TCOF1Q13428 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TCOF1Q13428 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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