Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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