Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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