Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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