Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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