Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SKIV2LQ15477 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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