Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
CSHL1Q14406 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms