Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SF3B2Q13435 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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