Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SRSF5Q13243 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms