Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTP4A2Q12974 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTP4A2Q12974 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTP4A2Q12974 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PTP4A2Q12974 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTP4A2Q12974 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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