Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
BPTFQ12830 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
BPTFQ12830 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms