Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPS29P62273 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPS29P62273 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPS29P62273 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms