Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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LMOD1P29536 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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