Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPREP23469 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPREP23469 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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