Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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