Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
VPREB1P12018 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms