Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EHD3Q9NZN3 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms