Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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RTL8BQ17RB0 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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RTL8BQ17RB0 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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RTL8BQ17RB0 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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