Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
RPE65Q16518 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.5 ms