Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CHRNA6Q15825 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CHRNA6Q15825 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms