Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HMGN3Q15651 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.59□□□□□ -2
HMGN3Q15651 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HMGN3Q15651 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HMGN3Q15651 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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